Le 27 juin 1927 est considéré comme le jour de la naissance de l'aéroport de Bourgas. La compagnie française SIDNA choisit, en ce jour, de construire une station de radio et une piste d'aviation. La station radio fut opérationnelle en 1938 et l'aérodrome fut transféré au Royaume de Bulgarie par la SIDNA. En 1942 arrivent des ingénieurs allemands afin d'adapter les infrastructures à l'atterrissage d'avions de plus grande taille. L'aérodrome fut notamment raccordé au réseau électrique et des citernes à carburants plus grandes furent construites.

Le 29 juin 1947, la ligne Sofia - Bourgas est inaugurée par le premier avion civil bulgare de transport de voyageurs, un « Junkers Ju 52 ». Dans les années 1950 et 60, l'activité de l'aéroport de Bourgas - comme celui des autres aéroports - croît rapidement. De ce fait, il est agrandi et modernisé : une piste en béton est construite, les équipements électriques et électroniques sont entièrement remplacés. Avec le développement du tourisme international et des voyages en avion, la plate-forme est transformée en aéroport international qui est relié à 45 destinations.

Afin de préparer l'avenir en modernisant les infrastructures et la gestion de la plate-forme, celle-ci est concédée, conjointement avec l'aéroport de Varna, à compter du 10 novembre 2006 et pour 35 ans, à la société bulgaro-allemande « Fraport Twin Star Airport  Management ». Le concessionnaire s’engage à investir au moins 403 millions d'euros, pendant cette période, pour la construction de nouveaux terminaux pour les voyageurs, l'amélioration des infrastructures aéroportuaires, l'élargissement des parkings d'avions et de véhicules, les rampes d'accès et l'acquisition d'équipements.

L'aéroport de Bourgas est unique en Europe par le nombre de jours d’ensoleillement. Sa piste de 3200m de long est la 4e dans les Balkans. De nos jours, il dessert 77 destinations dans 26 pays.